①以中药生长和采收时间命名
半夏，始见于《礼记•月令》:“仲夏之月，鹿角解，蝉始鸣，半夏生，木堇荣……五月半夏生，盖当夏之半也，故名”。
夏枯草，是因每至夏至而枯黄萎谢而得名。
忍冬藤，则因经冬不凋而得名。
②以人名命名
杜仲，相传是古代有一位叫杜仲的人，因服食此药而得道，后人遂以杜仲而命名。
徐长卿，始载于《神农本草经》，李时珍谓：“徐长卿，人名也，常以此药治邪病，人遂以名之”。
相传徐长卿是唐朝民间郎中，用采来的“蛇痢草”治愈了唐太宗李世民的蛇伤，为此李世民就赐草药名为“徐长卿”。
刘寄奴，是唯一以皇帝命名的草药名字。李时珍在《本草纲目·草部》第十五卷中曾记载，刘裕小名寄奴，在南征北战中，用草药治愈了无数受伤的将士，治外伤果有神效。人们就用刘裕的小名为此草命名，称之为“刘寄奴”，以作纪念。
③以产地而命名
在药名前冠以地名，以示其道地产区。古代会按照地名来命名，后世则多以当时的行政区命名。
如高良姜，陶弘景云：“此姜始出高良郡，故得此名”；
还有浙江的杭白芍、杭白菊、杭麦冬；
东北地区的关防风、关黄柏；
而像广藿香、广陈皮则是都产于广东。
从国外进口或产于我国少数民族地区的药材，也是按来源地命名。如主产于西班牙、希腊等国的番红花；多经西藏输入内地的藏红花；主产于朝鲜的高丽参，以及主产于日本的东洋参、美国的西洋参等。
④以药用部位来命名
中药来源甚广，植物、动物、矿物都可以入药，而像动物、植物类药材的药用部位皆不相同，以药用部位命名，也是中药常用的命名方法之一。
以植物类药材为例，就有分为根及根茎、茎木、花、种子及果实、叶、皮等部位。
像葛根、白茅根、板蓝根等，就是以根及根茎入药的药材。
以茎木入药的则是像鸡血藤、海风藤、石楠藤等；
以花入药的有金银花、菊花、旋覆花等；
以种皮、茎皮及根皮入药的有五加皮、地骨皮、桑白皮等；
以叶入药的有桑叶、淡竹叶、侧柏叶等；
以种子及果实入药的有蛇床子、菟丝子、桃仁等；
那像以矿石入药，则有朱砂、赭石、滑石、炉甘石等。
而动物药材中以器官、组织入药的有：鸡内金、鹿茸、鹿角等；以虫类动物全体入药的则有：僵蚕、地鳖虫等。
